تسمى الأمراض التي تسببها هذه المخلوقات الصغيرة والتي لا نستطيع رؤيتها بالعين المجردة بشكل عام بالعدوى. الآلاف من الكائنات الحية الدقيقة المختلفة تظهر كأمراض معدية.

يتم إجراء بعض الاختبارات لمعرفة ماهية هذه الالتهابات. في المختبر يتم أخذ سوائل الجسم والبول والبراز وعينات الدم وعينات الأنسجة من المرضى وإجراء الاختبارات اللازمة وتشخيص المرض. تُستخدم برامج الكمبيوتر أيضًا جنبًا إلى جنب مع الطرق التقليدية لتحديد الكائنات الحية الدقيقة. يتم اكتشاف الإصابة بالطفيليات نتيجة فحص بعض الفيروسات باستخدام اختبارات المستضدات السريعة.