يتم إجراء المناظير للأغراض التشخيصية والعلاجية من قبل أطباء متخصصين في القسم. يمكن تشخيص الأمراض عن طريق أخذ عينات الأنسجة من الأقسام الممتدة من الفم إلى الاثني عشر. تعتبر تقنية الصبغ فعالة في تحديد حدود الجروح المختلفة وإيجاد الجرح الذي يحتاج إلى خزعة. ويتم تقييم النتائج من قبل خبراء علم الأمراض.

في القسم، جميع أنواع المناظير السفلية والعلوية، والتدخل في حالات الطوارئ والعلاج بالحقن في نزيف الجهاز الهضمي، والعلاج بالتصليب وربط الشريط في نزيف الدوالي، واستئصال السليلة، وتوسيع البالون في حالات التضيق، وإزالة الأجسام الغريبة، ووضع الدعامات في الانسدادات غير القابلة للجراحة بسبب السرطان، يمكن إجراء تصوير البنكرياس والقنوات الصفراوية بالمنظار بالطريق الراجع للأغراض التشخيصية والعلاجية، كما يمكن إجراء خزعة الكبد.